mag-tarmkanalen är hemvist för trillioner av mikroorganismer som inkluderar bakterier, archaea, svampar och virus. De kollektiva genomen av hela mikrobiella samhällen (microbiota) integrerar tarmmikrobiomen. Upp till 100 släkten och 1000 olika bakteriearter identifierades i matsmältningsrörnischer. Tarmmikrobiom utövar permanenta pivotala funktioner genom att främja matförtunning, xenobiotisk metabolism och reglering av medfödda och adaptiva immunologiska processer., Proteiner, peptider och metaboliter frigörs lokalt och på avlägsna platser utlösa många cell signalering och vägar. Denna intensiva crosstalk upprätthåller värd-mikrobiell homeostas. Diet, ålder, kost, stress och sjukdomar orsakar ökningar eller minskningar i relativ överflöd och mångfald bakteriell specie av GI och andra kroppsdelar., Studier i djurmodeller och människor har visat att en bestående obalans i tarmens mikrobiella samhälle, som heter dysbios, hänför sig till inflammatoriska tarmsjukdomar (IBD), irritabelt tarmsyndrom (IBS), diabetes, fetma, cancer, kardiovaskulära och centrala nervsystemet. Särskilt specifika bakteriella samhällen lovar kliniskt mål för att behandla inflammatoriska och infektionssjukdomar. I detta sammanhang är intestinal microbiota transplantation (IMT) en valfri behandling för IBD, särskilt för patienter med återkommande Clostridium difficile-inducerad pseudo-membrankolit., Här diskuterar vi de senaste upptäckterna som förbinder hela tarmmikrobiomdysbios till metaboliska och inflammatoriska sjukdomar och potentiella profylaktiska och terapeutiska tillämpningar av fekal och fagterapi, probiotiska och prebiotiska dieter.