Den gastrointestinale (GI) – tarmkanalen er opholdssted for billioner af mikroorganismer, der omfatter bakterier, archaea, svampe og vira. De kollektive genomer af hele mikrobielle samfund (mikrobiota) integrerer tarmmikrobiomet. Op til 100 slægter og 1000 forskellige bakteriearter blev identificeret i fordøjelsesrør nicher. Tarmmikrobiomer udøver permanente pivotale funktioner ved at fremme madfordøjelse, xenenobiotisk metabolisme og regulering af medfødte og adaptive immunologiske processer., Proteiner, peptider og metabolitter frigivet lokalt og på fjerne steder udløser mange cellesignaler og-veje. Denne intense krydstale opretholder værtsmikrobielle homeostase. Diæt, alder, diæt, stress og sygdomme forårsager stigninger eller fald i relativ overflod og mangfoldighed bakteriel art af GI og andre kropssteder., Undersøgelser i dyremodeller og mennesker har vist, at en vedvarende ubalance i tarmen er mikrobielle samfund, som er opkaldt dysbiosis, vedrører inflammatoriske tarmsygdomme (IBD), irritabel tyktarm (IBS), diabetes, fedme, kræft, hjerte-kar og lidelser i centralnervesystemet. Især specifikke bakterielle samfund er lovende klinisk mål til behandling af inflammatoriske og infektionssygdomme. I denne sammenhæng er intestinal mikrobiota transplantation (IMT) en valgfri behandling af IBD, især til patienter med tilbagevendende Clostridium difficile-induceret pseudo-membran colitis., Her diskuterer vi om de seneste opdagelser forbinder hele tarmen mikrobiome dysbiosis til metaboliske og inflammatoriske sygdomme og potentielle profylaktiske og terapeutiske anvendelser af fækal og fagterapi, probiotiske og præbiotiske kostvaner.