această subsecțiune a secțiunii nume și taxonomie oferă o listă exhaustivă a tuturor denumirilor proteinei, de la cele utilizate în mod obișnuit la cele învechite, pentru a permite identificarea fără echivoc a unei proteine.această subsecțiune include, de asemenea, informații despre activitatea proteinei, cum ar fi o descriere precisă a mecanismului catalitic al enzimelor sau informații despre lanțurile proteice individuale sau domeniile funcționale conținute în ea, dacă sunt pertinente.,
subsecțiunea Uniprotkb/Swiss-Prot „nume de proteine”
subsecțiunea constă din 2 categorii și mai multe subcategorii de nume și abrevieri de proteine. Întotdeauna începe cu „numele recomandat” („RecName” în fișierul text plat). Numele Alternative sunt listate la rubrica „nume Alternative” („AltName” în fișierul text plat).
| Categoria de Teren | Subcategoria Câmp | Valori | Descriere |
|---|---|---|---|
| nume Recomandat | 1 | nume Complet recomandat de UniProt consorțiu., | |
| Short name(s) | 0-n | Abbreviation of the full name or acronym. | |
| EC | 0-n | Enzyme Commission number. | |
| Alternative name(s) | 0-n | Synonym of the recommended name (full name). | |
| Short name(s) | 0-n | Abbreviation of the full name or an acronym. | |
| EC | 0-n | Enzyme Commission number., | |
| Alternative name(s) | Allergen | 0-1 | See Allergen nomenclature and list of entries. |
| Alternative name(s) | Biotech | 0-1 | Name used in a biotechnological context. |
| Alternative name(s) | CD_antigen | 0-n | See Human cell differentiation molecules nomenclature and list of entries., |
| denumire alternativă | INN | 0-n | denumire internațională neproprietară: un nume generic pentru o substanță farmaceutică sau un ingredient farmaceutic activ care este o proprietate publică recunoscută la nivel global. |
Dacă se știe că o proteină este scindată în mai multe componente funcționale, descrierea începe cu denumirea proteinei precursoare, urmată de ” scindată în …”secțiune(secțiuni). Fiecare componentă este descrisă într-o secțiune separată. „Denumire(denumiri) alternativă (Alternative)” sunt permise pentru fiecare componentă în parte.,
Exemplu: P01189 (‘Scindat în următoarele 11 lanțuri:’)
Dacă o proteină este cunoscut pentru a include mai multe domenii funcționale, fiecare dintre care este descris de un alt nume, descrierea începe cu numele întreg proteine, urmat de „Inclusiv” secțiunea(s). Fiecare domeniu este descris într-o secțiune separată. „Nume Alternative” sunt permise pentru fiecare domeniu în parte.,
Exemplu: P27708 (‘Inclusiv următoarele 3 domenii:’)
UniProtKB/TrEMBL ‘Proteine nume’ subsecțiunea
format din Proteine nume secțiune în UniProtKB/TrEMBL urmează îndeaproape formatul utilizat în UniProtKB/Swiss-Prot. Cu toate acestea, deoarece Uniprotkb/TrEMBL nu este adnotat manual, descrierea este importată direct din Intrarea nucleotidelor subiacente, iar precizia acesteia se bazează pe informațiile furnizate de emitentul intrării nucleotidelor. Acesta este motivul pentru care intrările Uniprotkb/TrEMBL au de obicei „nume trimis” („SubName” în fișierul text plat) în loc de „nume recomandat”., Pot exista mai multe „nume trimis”. ‘A prezentat nume poate fi îmbunătățită prin adnotare automată a procedurilor (eticheta, atunci se va schimba din ‘SubName” la „RecName’), dar dacă nu, rămâne cum este prevăzut de către emitent până la intrarea manual adnotat și integrate pentru a UniProtKB/Swiss-Prot.