Uracil N-glykosylas (UNG) är ett enzym som används i en kraftfull metod för att eliminera korsöverföring polymeraskedjereaktion (PCR) produkter i realtid PCR. Denna metod ändrar PCR-produkter så att i en ny reaktion kommer eventuella restprodukter från tidigare PCR-förstärkningar att smälta och förhindras från att förstärka, men de sanna DNA-mallarna kommer inte att påverkas., PCR syntetiserar rikliga förstärkningsprodukter varje runda, men förorening av ytterligare rundor av PCR med spårmängder av dessa produkter, kallad överföring av förorening, ger falska positiva resultat. Överföringskontaminering från någon tidigare PCR kan vara ett betydande problem, både på grund av överflöd av PCR-produkter och till den ideala strukturen hos det förorenande materialet för återförstärkning., Men carry-over kontaminering kan kontrolleras genom följande två åtgärder: (i) som innehåller dUTP i alla PCR-produkter (genom att ersätta dUTP för dTTP, eller genom att införliva uracil under syntesen av primers; och (ii) behandla alla efterföljande helt förmonterad med start reaktioner med uracil DNA glycosylase (UDG), följt av termisk inaktivering av UDG. UDG klyver uracil-basen från fosfodiesterns ryggrad av uracil-innehållande DNA, men har ingen effekt på naturligt (dvs tymininnehållande) DNA., De resulterande apyrimidiniska platserna blockerar replikation med DNA-polymeraser och är mycket labila mot syra/bashydrolys. Eftersom UDG inte reagerar med DTTP, och också inaktiveras genom värmedenaturering före den faktiska PCR, kan överföring av PCR kontrolleras effektivt om föroreningarna innehåller uracils i stället för tyminer.
Uracil N-glykosylas användes också i en studie för att upptäcka tecken på pågående låg nivå metabolisk aktivitet och DNA reparation i gamla bakterier., Långtidsöverlevnad av bakterier kan uppstå antingen genom endosporebildning (där bakterien går in i total dvala, utan metabolisk aktivitet alls som äger rum, och därmed ingen DNA-reparation), annars genom minskning av metabolisk aktivitet till en mycket låg hastighet, bara tillräcklig för att utföra pågående DNA-reparation och förhindra utarmning av andra instabila molekyler (som ATP), där mikroben kan reparera skador på sitt DNA men fortsätter också att långsamt konsumera näringsämnen. DNA-sekvenser från bakterier i permafrost förstärktes med PCR., En serie körningar förstärkte DNA-sekvenserna as-is (för att upptäcka allt levande bakteriellt DNA i proverna), medan den andra serien letade specifikt efter DNA som hade genomgått pågående reparation; för att göra detta behandlades DNA med UNG för att avlägsna uracils. Detta förhindrade förstärkning av oreparerat DNA på två sätt: för det första hindrade de abasiska platserna som genererades genom avlägsnande av uracils DNA-polymerasen som användes i PCR från att gå förbi skadans plats, medan dessa abasiska platser också direkt försvagade DNA och gjorde det mer sannolikt att fragmentera vid uppvärmning., På så sätt kunde forskarna visa bevis på pågående DNA-reparation hos Höggc Gram-positiva bakterier upp till 600 000 år gamla.
uracil n glykosylas har också använts i en metod för kloning av PCR-förstärkta DNA-fragment. I denna metod syntetiseras primrarna som används i PCR med uracilrester istället för tymin. När dessa primers införlivas i PCR förstärkta fragment primern sekvensen blir mottaglig för matsmältningen med uracil n Glykosylas och producera 3 ’ utskjutande ändar som kan glödgas till en lämpligt beredd vektor DNA., De resulterande Chimera molekylerna kan omvandlas till kompetenta celler med hög effektivitet, utan behov av in vitro-ligering.