från 1924 till 1927 var flygfältet i Kalandia den enda flygplatsen i det brittiska mandatet för Palestina. Det användes av de brittiska militära myndigheterna och framstående gäster bundna till Jerusalem. År 1931, den obligatoriska regeringen exproprierade mark från den judiska byn Atarot att expandera flygfältet, i processen riva hem och upprota fruktodlingar. År 1936 öppnades flygplatsen för reguljära flygningar. Byn Atarot fångades och förstördes av den jordanska Arabiska legionen under 1948 års arabisk-israeliska krig.,
från 1948 till sexdagarskriget i juni 1967 var flygplatsen under jordansk kontroll, utsedd OJJR. Efter Sexdagarskriget införlivades Jerusalems Flygplats i Jerusalems stadsområde och utsågs LLJR.
På 1970-talet och början av 1980-talet investerade Israel betydande resurser för att uppgradera flygplatsen och skapa infrastrukturen för en fullfjädrad internationell flygplats, men de internationella luftfartsmyndigheterna, med tanke på att flygplatsen var i land som fångades 1967 av Israel, skulle inte tillåta internationella flygningar att landa där., Således flygplatsen användes endast för inrikesflyg och charterflyg.
på grund av säkerhetsproblem under den andra Intifada stängdes flygplatsen för civil flygtrafik i oktober 2000 och i juli 2001 överlämnades den formellt till Israels försvarsstyrkor.
i kartor som presenterades av Israel vid Camp David-toppmötet 2000 inkluderades Atarot i det israeliska uppbyggnadsområdet i Jerusalem. Detta förkastades av den palestinska delegationen, som föreställde sig den som en nationell flygplats för palestinierna., Yossi Beilin föreslog att flygplatsen skulle användas gemensamt som en del av en övergripande delning av Jerusalem mellan Israel och den palestinska myndigheten, med hänvisning till den framgångsrika modellen för Genèves internationella flygplats, som används av både Schweiz och Frankrike.