Dieser Unterabschnitt des Abschnitts Namen und Taxonomie enthält eine vollständige Liste aller Namen des Proteins, von allgemein verwendet bis veraltet, um eine eindeutige Identifizierung eines Proteins zu ermöglichen.
Dieser Unterabschnitt enthält auch Informationen über die Aktivität des Proteins, wie z. B. eine genaue Beschreibung des katalytischen Mechanismus von Enzymen oder gegebenenfalls Informationen über einzelne darin enthaltene Proteinketten oder funktionelle Domänen.,
UniProtKB / Swiss-Prot‘ Protein names ‚ Unterabschnitt
Der Unterabschnitt besteht aus 2 Kategorien und mehreren Unterkategorien von Proteinnamen und Abkürzungen. Es beginnt immer mit dem ‚Empfohlenen Namen‘ (‚RecName‘ in der flachen Textdatei). Alternative Namen werden unter der Überschrift ‚Alternative Name(s)‘ (‚AltName‘ in der flachen Textdatei) aufgeführt.
| Feld: Kategorie | Unterkategorie Feld | Kardinalität | Beschreibung |
|---|---|---|---|
| Empfohlen name | 1 | Full name, empfohlen durch das UniProt-consortium., | |
| Short name(s) | 0-n | Abbreviation of the full name or acronym. | |
| EC | 0-n | Enzyme Commission number. | |
| Alternative name(s) | 0-n | Synonym of the recommended name (full name). | |
| Short name(s) | 0-n | Abbreviation of the full name or an acronym. | |
| EC | 0-n | Enzyme Commission number., | |
| Alternative name(s) | Allergen | 0-1 | See Allergen nomenclature and list of entries. |
| Alternative name(s) | Biotech | 0-1 | Name used in a biotechnological context. |
| Alternative name(s) | CD_antigen | 0-n | See Human cell differentiation molecules nomenclature and list of entries., |
| Alternativer Name(s) | INN | 0-n | Internationaler nicht-proprietärer Name: ein generischer Name für einen pharmazeutischen Stoff oder pharmazeutischen Wirkstoff, der ein weltweit anerkanntes öffentliches Eigentum ist. |
Wenn bekannt ist, dass ein Protein in mehrere funktionelle Komponenten gespalten wird, beginnt die Beschreibung mit dem Namen des Vorläuferproteins, gefolgt von ‚Gespalten in …“abschnitt (e). Jede Komponente wird in einem separaten Abschnitt beschrieben. „Alternative Namen“ sind für jede einzelne Komponente zulässig.,
Beispiel: P01189 (‚In die folgenden 11 Ketten gespalten:‘)
Wenn bekannt ist, dass ein Protein mehrere funktionelle Domänen enthält, von denen jede mit einem anderen Namen beschrieben wird, beginnt die Beschreibung mit dem Namen des gesamten Proteins, gefolgt von Abschnitt (n) „Einschließlich“. Jede Domäne wird in einem separaten Abschnitt beschrieben. „Alternative Namen“ sind für jede einzelne Domäne zulässig.,
Beispiel: P27708 (‚Einschließlich der folgenden 3 domains:‘)
UniProtKB/TrEMBL ‚Protein Namen‘ subsection
Das format des „Eiweiß-Namen“ Abschnitt in UniProtKB/TrEMBL eng folgt dem format, in UniProtKB/Swiss-Prot. Da UniProtKB/TrEMBL jedoch nicht manuell mit Anmerkungen versehen wird, wird die Beschreibung direkt aus dem zugrunde liegenden Nukleotideintrag importiert und ihre Genauigkeit beruht auf den Informationen, die vom Submitter des Nukleotideintrags bereitgestellt werden. Aus diesem Grund haben UniProtKB/TrEMBL-Einträge normalerweise ‚Submitted name‘ (‚SubName’in der flachen Textdatei) anstelle von ‚Recommended name‘., Es kann mehr als einen „eingereichten Namen“ geben. ‚Eingereicht Namen‘ kann später verbessert werden, indem die automatische annotation Verfahren (die Bezeichnung ändert sich dann von ‚SubName‘, um ‚RecName‘), aber wenn nicht, bleibt es wie vom Einreicher, bis der Eintrag ist manuell annotiert und integriert, um UniProtKB/Swiss-Prot.