jest to główny mięsień służący do utrzymania moczu, funkcji współdzielonej z zewnętrznym zwieraczem cewki moczowej, który jest pod dobrowolną kontrolą. Zapobiega wyciekowi moczu, ponieważ mięsień jest tonicznie kurczony przez włókna współczulne podróżujące przez dolny splot hipogastryczny i pęcherzowy splot nerwowy., W szczególności jest kontrolowany przez nerw hipogastryczny, głównie przez receptor alfa-1.
podczas oddawania moczu neurony preganglioniczne tego szlaku współczulnego są hamowane przez sygnały pojawiające się w centrum oddawania moczu pontynowego i podróżujące przez zstępujące ciągi siateczkowo-rdzeniowe, umożliwiając rozluźnienie mięśnia. Podczas wytrysku mięśnie kurczą się, aby zapobiec refluksowi nasienia do pęcherza moczowego, zjawisku zwanym wytryskiem wstecznym.
skurcze zwieracza cewki wewnętrznej są związane z erekcją prącia., Ponieważ zwieracz cewki wewnętrznej jest pod mimowolną kontrolą, uważa się, że odgrywa rolę w ciemieniuchach, w których osoba, która postrzega się pod obserwacją, nie jest w stanie oddawać moczu.