ta podsekcja sekcji nazw i taksonomii zawiera wyczerpującą listę wszystkich nazw białka, od powszechnie używanych do przestarzałych, aby umożliwić jednoznaczną identyfikację białka.
podrozdział ten zawiera również informacje o aktywności białka, takie jak dokładny opis mechanizmu katalitycznego enzymów, lub informacje o poszczególnych łańcuchach białkowych lub domenach funkcjonalnych w nim zawartych, jeśli jest to istotne.,
podsekcja UniProtKB/Swiss-Prot 'Protein names'
podsekcja składa się z 2 kategorii i kilku podkategorii nazw i skrótów białek. Zawsze zaczyna się od ” zalecanej nazwy „(„RecName” w płaskim pliku tekstowym). Alternatywne nazwy są wymienione pod nagłówkiem „Alternatywne nazwy” („AltName” w płaskim pliku tekstowym).
| pole kategorii | pole podkategorii | Cardinality | opis |
|---|---|---|---|
| Nazwa rekomendowana | 1 | pełna nazwa rekomendowana przez konsorcjum UniProt., | |
| Short name(s) | 0-n | Abbreviation of the full name or acronym. | |
| EC | 0-n | Enzyme Commission number. | |
| Alternative name(s) | 0-n | Synonym of the recommended name (full name). | |
| Short name(s) | 0-n | Abbreviation of the full name or an acronym. | |
| EC | 0-n | Enzyme Commission number., | |
| Alternative name(s) | Allergen | 0-1 | See Allergen nomenclature and list of entries. |
| Alternative name(s) | Biotech | 0-1 | Name used in a biotechnological context. |
| Alternative name(s) | CD_antigen | 0-n | See Human cell differentiation molecules nomenclature and list of entries., |
| Alternatywne nazwy | INN | 0-N | międzynarodowa nazwa niezastrzeżona: ogólna nazwa substancji farmaceutycznej lub aktywnego składnika farmaceutycznego, która jest uznaną na całym świecie własnością publiczną. |
Jeśli wiadomo, że białko jest rozszczepione na wiele funkcjonalnych składników, opis zaczyna się od nazwy białka prekursorowego, a następnie ” rozszczepione na …”sekcja (- y). Każdy komponent jest opisany w osobnej sekcji. „Alternatywne nazwy” są dozwolone dla każdego pojedynczego komponentu.,
przykład: P01189 (’Cleaved into the following 11 chains:')
Jeśli wiadomo, że białko zawiera wiele domen funkcjonalnych, z których każda opisana jest inną nazwą, opis zaczyna się od nazwy całego białka, a następnie sekcji „Including”. Każda domena jest opisana w osobnej sekcji. „Alternatywne nazwy” są dozwolone dla każdej pojedynczej domeny.,
przykład: P27708 (’zawierający następujące 3 domeny:')
podsekcja UniProtKB/TrEMBL 'Protein names'
format sekcji 'Protein names' w UniProtKB/TrEMBL jest ściśle zgodny z formatem używanym w UniProtKB/Swiss-Prot. Jednakże, ponieważ UniProtKB / TrEMBL nie jest ręcznie adnotowany, opis jest importowany bezpośrednio z podstawowego wpisu nukleotydowego, a jego dokładność zależy od informacji dostarczonej przez zgłaszającego wpis nukleotydowy. Z tego powodu wpisy UniProtKB/TrEMBL zazwyczaj mają „Submission name” („SubName” w pliku tekstowym) zamiast „Recommended name”., Może być więcej niż jedna „zgłoszona nazwa”. „Nadesłane nazwy” mogą zostać później poprawione za pomocą automatycznych procedur adnotacji( Etykieta zmieni się z „SubName” na „RecName”), ale jeśli nie, pozostaje taka, jaką podał zgłaszający, dopóki wpis nie zostanie ręcznie adnotowany i zintegrowany z UniProtKB / Swiss-Prot.