Uracil N-glycosylase (UNG) is een enzym gebruikt in een krachtige methode om carryover polymerasekettingreactieproducten (PCR) te elimineren in Real-Time PCR. Deze methode wijzigt PCR-producten zodanig dat in een nieuwe reactie, om het even welke overblijvende producten van vorige PCR-versterkingen zullen worden verteerd en van versterking worden verhinderd, maar de ware malplaatjes van DNA onaangetast zullen zijn., PCR stelt overvloedige versterkingsproducten samen elke ronde, maar de verontreiniging van verdere rondes van PCR met spoorhoeveelheden van deze producten, genoemd carry-over verontreiniging, levert valse positieve resultaten op. Carry-over besmetting van één of andere vorige PCR kan een significant probleem zijn, toe te schrijven aan zowel de overvloed van PCR-producten, als aan de ideale structuur van het contaminantmateriaal voor re-versterking., Carry-over contaminatie kan echter worden gecontroleerd door de volgende twee stappen: (I) het opnemen van dUTP in alle PCR-producten (door dttp door dUTP te vervangen, of door uracil te gebruiken tijdens de synthese van primers; en (ii) het behandelen van alle daaropvolgende volledig voorgemonteerde startreacties met uracil DNA glycosylase (UDG), gevolgd door thermische inactivatie van UDG. UDG splijt de uracilbasis van de fosfodiëster-backbone van uracil-bevattend DNA, maar heeft geen effect op natuurlijk (d.w.z., thymine-bevattend) DNA., De resulterende apyrimidinic plaatsen blokkeren replicatie door polymerases van DNA, en zijn zeer labiel aan zuur/base hydrolyse. Omdat UDG niet reageert met dTTP, en ook geïnactiveerd door warmte denaturatie voorafgaand aan de werkelijke PCR, carry-over verontreiniging van PCR ‘ s kan effectief worden gecontroleerd als de verontreinigingen uracils in plaats van thymines bevatten.
Uracil N-glycosylase werd ook gebruikt in een studie om aanwijzingen op te sporen van aanhoudende lage metabole activiteit en DNA-herstel bij oude bacteriën., De overleving van bacteriën op lange termijn kan ofwel optreden door endosporevorming (waarbij de bacterie in totale rust komt, waarbij helemaal geen metabole activiteit plaatsvindt en dus geen DNA-reparatie plaatsvindt), ofwel door vermindering van metabole activiteit tot een zeer laag tarief, net voldoende om lopende DNA-reparatie uit te voeren en de uitputting van andere onstabiele moleculen (zoals ATP) te voorkomen, waarbij de microbe in staat is om schade aan zijn DNA te herstellen, maar ook langzaam voedingsstoffen blijft consumeren. DNA-sequenties van bacteriën in permafrost werden versterkt met behulp van PCR., Een reeks van looppas vergrootte de opeenvolgingen van DNA zoals-is (om al levend bacterieel DNA in de steekproeven te ontdekken), terwijl de andere reeks specifiek DNA zocht dat lopende reparatie had ondergaan; om dit te doen, werd DNA behandeld met UNG om uracils te verwijderen. Dit verhinderde versterking van unrepaired DNA op twee manieren: ten eerste, verhinderden de abasic plaatsen die door de verwijdering van uracils worden geproduceerd de polymerase van DNA die in PCR wordt gebruikt om voorbij de plaats van schade te gaan, terwijl deze abasic plaatsen ook direct DNA verzwakten en het waarschijnlijker maakten om bij het verwarmen te fragmenteren., Op deze manier, konden de onderzoekers bewijsmateriaal van lopende DNA-reparatie in hoog-GC Gram-positieve bacteriën tot 600.000 jaar oud tonen.
uracil n glycosylase is ook gebruikt in een methode voor het klonen van PCR-versterkte DNA-fragmenten. Bij deze methode worden de inleidingen die in PCR worden gebruikt samengesteld met uracilresiduen in plaats van thymine. Wanneer deze inleidingen in PCR versterkte fragmenten worden opgenomen wordt de inleidingsopeenvolging vatbaar voor spijsvertering met uracil n Glycosylase en produceert 3′ uitstekende einden die aan een aangewezen voorbereid vectordna kunnen worden onthard., De resulterende chimerische molecules kunnen in Bekwame cellen met hoog rendement, zonder de behoefte aan in vitro ligation worden omgezet.