De Jordaan is afkomstig uit de Anti-Libanon en de bergketens Hermon en beslaat een afstand van 223 km van noord naar Zuid en lozingen in de Dode Zee. De rivier heeft vijf oevers: Israël, Jordanië, Libanon, Palestina en Syrië.de bovenloop van de Jordaan (Hasbani, Banias en Dan) wordt gevoed door grondwater en seizoensgebonden afvoer van het oppervlak., De benedenloop van de Jordaan kreeg oorspronkelijk zijn belangrijkste instroom van de uitlaat van het Tiberias-meer en de Jarmouk-rivier, de grootste zijrivier, evenals van verschillende wadi ‘ s en aquifers. De stroom van de bovenloop van de Jordaan naar het Tiberias-meer blijft vrijwel natuurlijk, maar de stroomsnelheid in het stroomafwaarts gelegen deel van de rivier is de laatste 50 jaar sterk gedaald als gevolg van de aanleg van een reeks infrastructuur-en omleidingsprojecten in het stroomgebied. Bijvoorbeeld, de gemiddelde jaarlijkse historische stroom van de Yarmouk die werd geschat op 450-500 MCM in de jaren 1950 is vandaag gedaald tot 83-99 MCM., De huidige jaarlijkse lozing van de benedenloop van de Jordaan in de Dode Zee wordt geschat op 20-200 MCM, vergeleken met de historische 1.300 MCM. Bovendien is de waterkwaliteit in de benedenloop van de Jordaan zeer laag.
het watergebruik in het stroomgebied van de Jordaan is ongelijkmatig ontwikkeld. Palestina en Syrië hebben geen toegang tot de Jordaan; hun gebruik van waterbronnen uit de rivier zelf is dan ook nihil. Syrië heeft echter verschillende dammen gebouwd in het Deelbekken van de rivier de Yarmouk, dat deel uitmaakt van het stroomgebied van de Jordaan., Het land gebruikt ongeveer 450 miljoen m3 / jaar oppervlakte-en grondwatervoorraden in het bekken, voornamelijk voor landbouwdoeleinden. De jaarlijkse onttrekkingen in het Hasbani-deelbekken in Libanon worden geschat op 9-10 MCM, die voornamelijk worden gebruikt voor de watervoorziening van huishoudens. Israël is de grootste gebruiker van water uit het stroomgebied van de Jordaan, met een jaarlijkse terugtrekking van tussen 580 en 640 MCM. Het is ook de enige gebruiker van water uit het Meer van Tiberias. Jordanië gebruikt ongeveer 290 MCM / jaar water uit het stroomgebied van de Jordaan., Het water van de Yarmouk naar het King Abdullah Canal wordt gebruikt voor irrigatie van gewassen in de Jordaanvallei en voor huishoudelijk gebruik in Amman. In totaal heeft het stroomgebied van de Jordaan een geschatte totale geïrrigeerde oppervlakte van 100.000 tot 150.000 ha, waarvan ongeveer 30% in Israël, Jordanië en Syrië, 5% in Palestina en 2% in Libanon ligt.de kwaliteit van het water in de Jordaan is de afgelopen decennia sterk verslechterd., Terwijl de bovenloop relatief onaangetast is, bestaat de benedenloop van de Jordaan voornamelijk uit onbehandeld rioolwater en agrarische terugvloeiingsstromen, grondwater, evenals brak water uit bronnen die buiten het Tiberias-gebied in de rivier worden omgeleid. Vooral de benedenloop van de Jordaan is zeer vervuild. Andere milieuproblemen zijn onder meer de schommelingen van het waterpeil in het Tiberias-meer en het daarmee gepaard gaande risico van binnendringen van zoutwater van onderaf, en, nog belangrijker, de achteruitgang van de Dode Zee, die alle een bedreiging vormen voor de stabiliteit van het ecosysteem van het bekken.,sinds het begin van de 20e eeuw zijn talrijke pogingen om de samenwerking tussen stroombekken oeverstaten te bevorderen, gehinderd door het regionale politieke conflict, dat nog steeds een akkoord over water in de weg staat. Een aantal bilaterale overeenkomsten bevordert de samenwerking op het gebied van water tussen Israël en Jordanië en Israël en Palestina.