deze subsectie van de sectie namen en taxonomie geeft een uitputtende lijst van alle namen van het eiwit, van algemeen gebruikt tot verouderd, om een eenduidige identificatie van een eiwit mogelijk te maken.
deze subsectie bevat ook informatie over de activiteit van het eiwit, zoals een nauwkeurige beschrijving van het katalytische mechanisme van enzymen, of informatie over individuele eiwitketens of functionele domeinen daarin, indien relevant.,
uniprotkb/Swiss-Prot “Protein names” subsectie
de subsectie bestaat uit 2 categorieën en verscheidene subcategorieën van eiwitnamen en afkortingen. Het begint altijd met de’ Recommended name ‘(‘RecName’ in het platte tekstbestand). Alternatieve namen staan vermeld onder de kop ‘alternatieve naam (en)’ (‘AltName’ in het platte tekstbestand).
| category Field | subcategorie Field | kardinaliteit | Description | aanbevolen naam | 1 | volledige naam aanbevolen door het uniprot-consortium., |
|---|---|---|---|
| Short name(s) | 0-n | Abbreviation of the full name or acronym. | |
| EC | 0-n | Enzyme Commission number. | |
| Alternative name(s) | 0-n | Synonym of the recommended name (full name). | |
| Short name(s) | 0-n | Abbreviation of the full name or an acronym. | |
| EC | 0-n | Enzyme Commission number., | |
| Alternative name(s) | Allergen | 0-1 | See Allergen nomenclature and list of entries. |
| Alternative name(s) | Biotech | 0-1 | Name used in a biotechnological context. |
| Alternative name(s) | CD_antigen | 0-n | See Human cell differentiation molecules nomenclature and list of entries., |
| alternatieve naam (en) | INN | 0-n | internationale algemene naam: een generieke naam voor een farmaceutische stof of Actief Farmaceutisch ingrediënt dat een wereldwijd erkend publiek goed is. |
als bekend is dat een eiwit in meerdere functionele componenten is gesplitst, begint de beschrijving met de naam van het precursor-eiwit, gevolgd door ” gesplitst in …”sectie (s). Elke component wordt beschreven in een aparte sectie. “Alternatieve naam( namen)” zijn toegestaan voor elk afzonderlijk onderdeel.,
voorbeeld: P01189 (‘gesplitst in de volgende 11 ketens:’)
als van een eiwit bekend is dat het meerdere functionele domeinen bevat, die elk met een andere naam worden beschreven, begint de beschrijving met de naam van het hele eiwit, gevolgd door de sectie(S) ‘inclusief’. Elk domein wordt beschreven in een aparte sectie. “Alternatieve naam(namen)” zijn toegestaan voor elk afzonderlijk domein.,
voorbeeld: P27708 (‘met inbegrip van de volgende 3 domeinen:’)
uniprotkb/TrEMBL’ Eiwitnamen ‘subsectie
het formaat van de sectie’ Eiwitnamen ‘ in UniProtKB/TrEMBL volgt nauw het formaat dat wordt gebruikt in UniProtKB/Swiss-Prot. Aangezien UniProtKB / TrEMBL echter niet handmatig wordt geannoteerd, wordt de beschrijving rechtstreeks geïmporteerd uit de onderliggende nucleotide-ingang en de nauwkeurigheid ervan berust op de informatie die wordt verstrekt door de indiener van de nucleotide-ingang. Dit is de reden waarom UniProtKB / TrEMBL vermeldingen meestal ‘Subname’ (‘SubName’ in het platte tekstbestand) hebben in plaats van ‘Recommended name’., Er kan meer dan één ‘ingezonden naam’zijn. ‘Ingediende namen ‘kunnen later worden verbeterd door automatische annotatieprocedures (het label zal dan veranderen van’ SubName ‘naar’ RecName’), maar zo niet, blijft het zoals verstrekt door de indiener totdat het item handmatig is geannoteerd en geïntegreerd in UniProtKB/Swiss-Prot.