Uracil N-glycosylase (UNG) er et enzym som brukes i en kraftig metode for å eliminere overføring polymerase chain reaction (PCR) produkter i Real-Time PCR. Denne metoden endrer PCR-produkter, slik at du i en ny reaksjon, eventuelle gjenværende produkter fra tidligere PCR amplifikasjoner vil bli fordøyd og forhindret fra å forsterke, men sant DNA-maler vil være upåvirket., PCR syntetiserer rikelig forsterkning produkter hver runde, men forurensning av flere runder av PCR med spormengder av disse produktene, som kalles carry-over forurensning, gir falske positive resultater. Carry-over forurensning fra noen tidligere PCR kan være et betydelig problem, både på grunn av overflod av PCR-produkter, og til den ideelle struktur av forurensning materiell for re-amplifikasjon., Men carry-over forurensning kan bli kontrollert av følgende to trinn: (i) å innlemme dUTP i alle PCR-produkter (ved å erstatte dUTP for dTTP, eller ved å innlemme uracil i løpet syntese av primere; og (ii) behandling av alle etterfølgende fullt monterte starter reaksjoner med uracil-DNA glycosylase (UDG), etterfulgt av termisk inaktivering av UDG. UDG cleaves den uracil base fra phosphodiester ryggraden i uracil-som inneholder DNA, men har ingen effekt på naturlige (dvs., innhold av tymin-holdige) DNA., Den resulterende apyrimidinic nettsteder blokkere replikasjon av DNA polymerases, og er svært labil til syre/base hydrolyse. Fordi UDG ikke reagerer med dTTP, og er også inaktivert av varme denaturering før selve PCR, carry-over forurensning av pcr-er kan kontrolleres effektivt hvis forurensninger inneholder uracils i stedet for thymines.
Uracil N-glycosylase ble også brukt i en studie for å avdekke bevis på pågående lavt nivå metabolsk aktivitet og DNA-reparasjon i gamle bakterier., Langsiktig overlevelse av bakterier kan skje enten gjennom endospore dannelse (der bakterien går inn totalt dvalen, uten metabolsk aktivitet i det hele tatt finner sted, og, dermed, ingen DNA-reparasjon), eller annet gjennom reduksjon av metabolske aktiviteten til en svært lav pris, akkurat tilstrekkelig til å gjennomføre pågående DNA-reparasjon og hindre utarming av andre ustabile molekyler (som ATP), der mikrobe er i stand til å reparere skade sin DNA, men fortsetter også å sakte oppta næringsstoffer. DNA-sekvenser fra bakterier i permafrost ble amplifisert ved bruk av PCR., En rekke kjører amplifisert DNA-sekvenser som den er (for å oppdage alle live-bakteriell DNA i prøvene), mens den andre serien så spesielt for DNA som hadde vært under pågående reparasjon; for å gjøre dette, DNA ble behandlet med UNG til å fjerne uracils. Dette forhindret forsterkning av ureparert DNA på to måter: for det første, den abasic nettsteder som er generert av fjerning av uracils forhindret DNA-polymerase brukt i PCR-fortsetter fra fortiden siden av skade, mens disse abasic nettsteder også direkte svekket DNA og gjort det mer sannsynlig til å fragmentere ved oppvarming., På denne måten kan forskerne var i stand til å vise bevis på pågående DNA-reparasjon i høy-GC-Gram-positive bakterier opp til 600,000 år gammel.
Uracil N-glycosylase har også blitt brukt i en metode for kloning av PCR-amplifisert DNA-fragmenter. I denne metoden primere som brukes i PCR er syntetisert med uracil rester i stedet for innhold av tymin. Når disse primerne er innlemmet i PCR-forsterket fragmenter primeren sekvens blir utsatt for fordøyelsen med Uracil N-Glycosylase og produsere 3′ utstikkende ender som kan bli herdet til en passende forberedt vektor-DNA., Den resulterende chimeric molekyler som kan bli forvandlet til kompetente celler med høy effektivitet, uten behov for in vitro ligation.