Dette ledd av Navn og taksonomi delen inneholder en uttømmende liste over alle navn av protein, som vanligvis brukes til å foreldet, for å tillate entydig identifikasjon av et protein.
Dette ledd omfatter også informasjon om aktiviteten av protein, for eksempel en presis beskrivelse av katalytisk mekanisme av enzymer, eller informasjon om individuelle protein kjeder eller funksjonelle domener som finnes i det, hvis relevant.,
UniProtKB/Swiss-Prot ‘Protein navn’ første ledd
Den første ledd består av 2 kategorier og flere underkategorier av protein navn og forkortelser. Det begynner alltid med ‘Anbefalt navn’ (‘RecName’ i flat tekstfil). Alternative navn er oppført under overskriften » Alternative name(s)’ (‘AltName’ i flat tekstfil).
| Kategori Feltet | Underkategori Feltet | Cardinality | Beskrivelse |
|---|---|---|---|
| Anbefalt navn | 1 | Fulle navn er anbefalt av UniProt consortium., | |
| Short name(s) | 0-n | Abbreviation of the full name or acronym. | |
| EC | 0-n | Enzyme Commission number. | |
| Alternative name(s) | 0-n | Synonym of the recommended name (full name). | |
| Short name(s) | 0-n | Abbreviation of the full name or an acronym. | |
| EC | 0-n | Enzyme Commission number., | |
| Alternative name(s) | Allergen | 0-1 | See Allergen nomenclature and list of entries. |
| Alternative name(s) | Biotech | 0-1 | Name used in a biotechnological context. |
| Alternative name(s) | CD_antigen | 0-n | See Human cell differentiation molecules nomenclature and list of entries., |
| Alternative name(s) | INN | 0-n | Internasjonal opphavsrettslig navn: en generisk navn for en farmasøytisk stoff eller aktive farmasøytiske ingrediensen som er en globalt anerkjent offentlig eiendom. |
Hvis et protein som er kjent for å være spaltet i flere funksjonelle komponenter, beskrivelse starter med navnet på den forløper protein, etterfulgt av » Spaltet inn …»- delen(e). Hver komponent er beskrevet i et eget avsnitt. ‘Det Alternative navnet(s)» er tillatt for hver enkelt komponent.,
Eksempel: P01189 (‘Spaltet i følgende 11 kjeder:’)
Hvis et protein som er kjent for å inkludere flere funksjonelle domener, som hver er beskrevet med et annet navn, beskrivelse starter med navnet på hele protein, etterfulgt av «Blant annet» – delen(e). Hvert domene er beskrevet i et eget avsnitt. ‘Det Alternative navnet(s)» er tillatt for hvert enkelt domene.,
Eksempel: P27708 (Herunder følgende 3 domener:’)
UniProtKB/TrEMBL ‘Protein navn’ første ledd
format ‘Protein navn’ – seksjonen i UniProtKB/TrEMBL følger tett formatet som brukes i UniProtKB/Swiss-Prot. Men, som UniProtKB/TrEMBL er ikke manuelt forklart, den beskrivelse som er importert direkte fra underliggende nukleotid oppføring og dens nøyaktighet er avhengig av den informasjon som er gitt av avsenderen av nukleotid-oppføring. Dette er grunnen til UniProtKB/TrEMBL oppføringer vanligvis har Skrevet navnet’ (‘SubName’ i flat tekstfil) i stedet for «Anbefalt navn’., Det kan være mer enn en «Levert navn’. ‘Innsendt navn’ kan senere bli bedre ved å automatisk kommentar prosedyrer (etiketten vil da endres fra ‘SubName’ til ‘RecName’), men hvis ikke, det er gitt av avsenderen til oppføringen er manuelt forklart og integrert til UniProtKB/Swiss-Prot.