Dal 1924 al 1927, l’aeroporto di Kalandia fu l’unico aeroporto del Mandato britannico per la Palestina. E ‘ stato utilizzato dalle autorità militari britanniche e ospiti di spicco diretti a Gerusalemme. Nel 1931, il governo obbligatorio espropriò la terra dal villaggio ebraico di Atarot per espandere l’aeroporto, nel processo di demolizione delle case e sradicamento dei frutteti. Nel 1936, l’aeroporto fu aperto per voli regolari. Il villaggio di Atarot fu catturato e distrutto dalla Legione araba giordana durante la guerra arabo-israeliana del 1948.,
Dal 1948 alla guerra dei Sei Giorni nel giugno 1967, l’aeroporto era sotto il controllo giordano, designato OJJR. Dopo la guerra dei sei giorni, l’aeroporto di Gerusalemme fu incorporato nell’area municipale della città di Gerusalemme e fu designato LLJR.
Negli anni 1970 e nei primi anni 1980, Israele investì notevoli risorse nel potenziamento dell’aeroporto e nella creazione dell’infrastruttura per un aeroporto internazionale a tutti gli effetti, ma le autorità aeronautiche internazionali, tenendo presente che l’aeroporto si trovava in terre catturate da Israele nel 1967, non avrebbero permesso ai voli internazionali di atterrare lì., Pertanto l’aeroporto è stato utilizzato solo per voli nazionali e voli charter.
A causa di problemi di sicurezza durante la Seconda Intifada, l’aeroporto è stato chiuso al traffico aereo civile nell’ottobre 2000 e nel luglio 2001 è stato formalmente consegnato alle Forze di Difesa israeliane.
Nelle mappe presentate da Israele al Vertice di Camp David del 2000, Atarot è stato incluso nell’area edificata israeliana di Gerusalemme. Ciò è stato respinto dalla delegazione palestinese, che lo ha immaginato come un aeroporto nazionale per i palestinesi., Yossi Beilin ha proposto che l’aeroporto sia utilizzato congiuntamente come parte di una condivisione globale di Gerusalemme tra Israele e Autorità palestinese, citando il modello di successo dell’aeroporto internazionale di Ginevra, utilizzato sia dalla Svizzera che dalla Francia.