A Libanon-ellenes és a Hermon-Hegyláncból származó Jordán folyó északról délre 223 km-re húzódik, és a Holt-tengerbe ömlik. A folyónak öt partraszállója van: Izrael, Jordánia, Libanon, Palesztina és Szíria.
A Jordán folyó vízfolyásait (Hasbani, Banias és Dan) a felszín alatti vizek és a szezonális felszíni lefolyások táplálják., Az alsó-Jordán folyó eredetileg a Tiberias-tó és a Yarmouk-folyó torkolatából, a legnagyobb mellékfolyóból, valamint több wadisból és víztartó rétegből származott. A felső-Jordán folyó Tiberias-tóba történő áramlása szinte természetes marad, de a folyó alsó részén az áramlási sebesség az elmúlt 50 évben jelentősen csökkent a medencében kialakított infrastruktúra és elterelési rendszerek sorozatának építése miatt. Például a Yarmouk átlagos éves történelmi áramlása, amelyet az 1950-es években 450-500 MCM-re becsültek, ma 83-99 MCM-re csökkent., Az alsó-Jordán folyó Holt-tengerbe történő jelenlegi éves kibocsátását 20-200 MCM-re becsülik a történelmi 1300 MCM-hez képest. Ráadásul az alsó-Jordán folyó vízminősége nagyon alacsony.
a Jordán folyó medencéjében a vízhasználat egyenlőtlenül alakul ki. Palesztinának és Szíriának nincs hozzáférése a Jordán folyóhoz, ezért a folyóból származó vízkészletek felhasználása nulla. Szíria azonban számos gátat épített a Yarmouk folyó al-medencéjében, amely a Jordán folyó medencéjének része., Az ország mintegy 450 MCM/év felszíni és felszín alatti vízkészletet használ fel a medencében, elsősorban mezőgazdasági célokra. A Libanoni Hasbani al-medencében az éves absztrakciókat 9-10 MCM-re becsülik, amelyeket elsősorban háztartási vízellátásra használnak. Izrael a legnagyobb vízfelhasználó a Jordán folyó medencéjéből, évente 580-640 MCM-es vízkivétellel. A Tiberias-tóból származó víz egyetlen felhasználója. Jordánia körülbelül 290 MCM/év vizet használ a Jordán folyó medencéjéből., A Yarmouk folyóból az Abdullah király-csatornába átirányított vizet a Jordán-völgyben lévő növények öntözésére, Ammánban pedig háztartási használatra használják. Összességében a Jordán folyó medencéjének becsült teljes öntözött területe 100 000-150 000 hektár, ebből mintegy 30% Izraelben, Jordániában és Szíriában, 5% Palesztinában és 2% Libanonban található.
a Jordán folyó vízminősége az elmúlt évtizedekben súlyosan romlott., Míg a fejvizek viszonylag érintetlenek, az alsó-Jordán folyó elsősorban a kezeletlen szennyvíz és a mezőgazdasági visszatérési áramlások, a talajvíz szivárgása, valamint a Tiberias-tótól távol eső folyóba átirányított forrásokból származó sós víz. Különösen az alsó Jordán folyó rendkívül szennyezett. Egyéb környezeti aggályok közé tartozik a Tiberias-tó vízszintjének ingadozása, valamint a sós víz alulról történő behatolásának kockázata, és ami még fontosabb, a Holt-tenger csökkenése, amely mind veszélyezteti a medence ökoszisztémájának stabilitását.,
a 20. század eleje óta számos kísérletet akadályozott meg a medenceteremtők közötti együttműködés elősegítésére a regionális politikai konfliktus, amely továbbra is a víz minden medencére kiterjedő megállapodásának útjában áll. Számos kétoldalú megállapodás ösztönzi az Izrael és Jordánia, valamint Izrael és Palesztina közötti vízügyi együttműködést.