A nevek és a taxonómia szakasz ezen alszakasza kimerítő listát nyújt a fehérje összes nevéről, az általánosan használttól az elavultig, hogy lehetővé tegye a fehérje egyértelmű azonosítását.
Ez az alszakasz tartalmazza a fehérje aktivitására vonatkozó információkat is, például az enzimek katalitikus mechanizmusának pontos leírását, vagy adott esetben a benne található egyes fehérjeláncokról vagy funkcionális doménekről szóló információkat.,
UniProtKB / Swiss-Prot “Protein names” alszakasz
az alszakasz 2 kategóriából és a fehérjenevek és rövidítések több alkategóriájából áll. Mindig az “ajánlott név” (“RecName” a lapos szöveges fájlban) kezdődik. Az alternatív nevek az “alternatív név(ek)” (“AltName” a lapos szövegfájlban) címsor alatt találhatók.
| kategória mező | alkategória mező | Kardinalitás | leírás | ||
|---|---|---|---|---|---|
| ajánlott név | 1 | Teljes név az UniProt konzorcium által ajánlott., | |||
| Short name(s) | 0-n | Abbreviation of the full name or acronym. | |||
| EC | 0-n | Enzyme Commission number. | |||
| Alternative name(s) | 0-n | Synonym of the recommended name (full name). | |||
| Short name(s) | 0-n | Abbreviation of the full name or an acronym. | |||
| EC | 0-n | Enzyme Commission number., | |||
| Alternative name(s) | Allergen | 0-1 | See Allergen nomenclature and list of entries. | ||
| Alternative name(s) | Biotech | 0-1 | Name used in a biotechnological context. | ||
| Alternative name(s) | CD_antigen | 0-n | See Human cell differentiation molecules nomenclature and list of entries., | ||
| alternatív név(ek) | INN | 0-n | Nemzetközi nem kisajátítási név: egy gyógyszeripari anyag vagy hatóanyag általános neve, amely világszerte elismert köztulajdon. |
ha ismert, hogy egy fehérje több funkcionális komponensre hasad, a leírás a prekurzor fehérje nevével kezdődik, majd a “hasítódik be”…”szakasz(ok). Minden komponenst külön szakaszban ismertetünk. “Alternatív név(ek)” minden egyes összetevő esetében megengedett.,
példa: P01189 (“hasítva a következő 11 láncra:”)
Ha egy fehérjéről ismert, hogy több funkcionális domaint is tartalmaz, amelyek mindegyikét egy másik név írja le, a leírás a teljes fehérje nevével kezdődik, amelyet a “beleértve” szakasz(ok) követnek. Minden tartományt külön szakasz ír le. Az “alternatív név(ek)” minden egyes domain esetében megengedett.,
példa: P27708 (“beleértve a következő 3 domaint:”)
UniProtKB/TrEMBL “Protein names” alszakasz
A “Protein names” szakasz formátuma az UniProtKB/TrEMBL-ben szorosan követi az UniProtKB/Swiss-Prot-ban használt formátumot. Mivel azonban az UniProtKB / TrEMBL-t nem kézzel jegyzik, a leírás közvetlenül a mögöttes nukleotidbevitelből importálódik, pontossága pedig a nukleotidbevitel benyújtója által szolgáltatott információkra támaszkodik. Ez az oka annak, hogy az UniProtKB / TrEMBL bejegyzések általában “elküldött nevet” (“Alnév” a lapos szöveges fájlban) tartalmaznak az “ajánlott név” helyett., Nem lehet több, mint egy “benyújtott név”. ‘Benyújtott nevek’ később továbbfejlesztett automatikus jegyzet eljárások (a címke majd változtatni a ‘SubName”, hogy “RecName’), de ha nem, úgy marad, mint amelyet a beküldő, amíg a bejegyzés kézzel annotált, integrált hogy UniProtKB/Swiss-Prot.