Les rhinovirus humains (HRVs) et les entérovirus humains (HEVs) sont la cause la plus fréquente d’infections chez les personnes dans le monde. Ils sont membres du genre Enterovirus de la famille des virus Picornaviridae. Ce sont de petits virus (diamètre 30nmin) avec un génome d’ARN simple brin infectieux de 7 000 à 7 500 nucléotides enfermés dans une capside icosaédrique. Les VRH comprennent 153 types actuellement connus répartis en trois espèces (A, B et C), tandis que les VHE se composent de 104 types appartenant à quatre espèces (A, B, C et D)., Traditionnellement, les entérovirus humains sont classés en poliovirus et entérovirus non polio (coxsackievirues, échovirus et entérovirus numérotés).
Les VRC sont la cause habituelle du rhume mais sont également fréquemment trouvés dans l’otite moyenne, la sinusite, la bronchite, la pneumonie et les exacerbations d’asthme. Par conséquent, en raison de leur limitation aux voies respiratoires, le mode de transmission se fait principalement par l’intermédiaire d’aérosols de gouttelettes respiratoires et de fomites (surfaces contaminées), y compris un contact direct de personne à personne., Actuellement, il n’existe pas de traitement antiviral spécifique pour l’infection à rhinovirus.
Contrairement aux VHC, la réplication des VHC n’est pas limitée aux voies respiratoires, mais peut également avoir lieu dans l’intestin grêle et se propager à divers organes cibles. Ils sont facilement transmis de personne à personne par voie aérienne et/ou par voie fécale-orale, voire par des objets contaminés. La plupart des infections au VHE sont asymptomatiques ou manifestent des symptômes semblables au rhume., Cependant, les infections à HEV peuvent être plus graves, provoquant une poliomyélite, une méningite, une encéphalite, une myocardite, un exanthème, une conjonctivite hémorragique aiguë et des infections généralisées sévères chez les nouveau-nés. Par conséquent, la collecte d’échantillons pour le diagnostic HEVs doit être effectuée en fonction des manifestations cliniques. Le liquide céphalo-rachidien (LCR), le sang, les échantillons respiratoires et les échantillons de selles sont couramment utilisés.
Le diagnostic différentiel des infections par le VHR et le VHE est important sur le plan épidémiologique., L’identification spécifique de ces virus a déjà des implications pour la prise en charge de soutien des patients et deviendra plus importante lorsque des médicaments antiviraux spécifiques seront disponibles. Les techniques d’amplification des acides nucléiques ont remplacé l’isolement des virus dans les cultures cellulaires comme méthode de choix pour la détection des picornavirus, en partie en raison de la sensibilité, de la spécificité et de la rapidité exceptionnelles de ces techniques. Les espèces récemment identifiées C HRVs ne peuvent pas être cultivées dans des lignées cellulaires standard mais peuvent être amplifiées par transcription inverse (RT)-PCR., Les HRV et les HEV ont conservé des régions non codantes de 5’ (NCR) et quelques motifs de séquence presque identiques, permettant la conception d’amorces universelles pour leur amplification dans RT-qPCR. Il a été démontré que le RT-qPCR est beaucoup plus sensible que la culture cellulaire pour la détection de ces virus.