À proprement parler, la diversité des espèces est le nombre d’espèces différentes dans une zone particulière (richesse en espèces) pondéré par une certaine mesure d’abondance telle que le nombre d’individus ou la biomasse. Cependant, il est courant pour les biologistes de la conservation de parler de diversité des espèces même lorsqu’ils se réfèrent en fait à la richesse des espèces.
Une autre mesure de la diversité des espèces est la régularité des espèces, qui est l’abondance relative avec laquelle chaque espèce est représentée dans une zone., Un écosystème où toutes les espèces sont représentées par le même nombre d’individus d’espèces élevée régularité. Un écosystème où certaines espèces sont représentées par de nombreux individus, et d’autres espèces sont représentées par très peu d’individus a une faible régularité des espèces. Le tableau montre l’abondance des espèces (nombre d’individus par hectare) dans trois écosystèmes et donne les mesures de la richesse en espèces (S), de la régularité (E) et de l’indice de diversité de Shannon (H).
Indice de diversité de Shannon \(H= – p p_iln (p_i)\)
Voir Gibbs et al., 1998: p157 et Beals et coll. (2000) pour discussion et exemples., Magurran (1988) discute également des méthodes de quantification de la diversité.
Dans le tableau, l’écosystème A présente la plus grande diversité en termes de richesse en espèces. Cependant, l’écosystème B pourrait être décrit comme étant plus riche dans la mesure où la plupart des espèces présentes sont plus uniformément représentées par le nombre d’individus; ainsi, la valeur d’uniformité des espèces (E) est plus grande. Cet exemple illustre également une condition souvent observée dans les écosystèmes tropicaux, où la perturbation de l’écosystème fait que les espèces peu communes deviennent encore moins communes et les espèces communes encore plus communes., La perturbation de l’écosystème B peut produire l’écosystème C, où l’espèce peu commune 3 est devenue moins commune, et l’espèce relativement commune 1 est devenue plus commune. Il peut même y avoir une augmentation du nombre d’espèces dans certains écosystèmes perturbés, mais, comme indiqué ci-dessus, cela peut se produire avec une réduction concomitante de l’abondance des individus ou une extinction locale des espèces les plus rares.
La richesse et la régularité des espèces sont probablement les mesures les plus fréquemment utilisées de la biodiversité totale d’une région., La diversité des espèces est également décrite en termes de diversité phylogénétique, ou de parenté évolutive, des espèces présentes dans une zone. Par exemple, certaines zones peuvent être riches en taxons étroitement apparentés, ayant évolué à partir d’un ancêtre commun qui a également été trouvé dans cette même zone, tandis que d’autres zones peuvent avoir un éventail d’espèces moins étroitement apparentées descendant d’ancêtres différents (voir d’autres commentaires dans la section sur la diversité des espèces comme substitut de la biodiversité mondiale).
Pour compter le nombre d’espèces, nous devons définir ce qui constitue une espèce., Il existe plusieurs théories concurrentes, ou « concepts d’espèces » (Mayden, 1997). Les plus largement acceptés sont le concept d’espèce morphologique, le concept d’espèce biologique et le concept d’espèce phylogénétique.
Bien que le concept d’espèce morphologique (MSC) soit largement dépassé en tant que définition théorique, il est encore largement utilisé. Selon ce concept: les espèces sont les plus petits groupes qui sont distincts de manière cohérente et persistante, et distinguables par des moyens ordinaires. (Cronquist, 1978)., En d’autres termes, le concept d’espèce morphologique stipule qu ‘ « une espèce est une communauté, ou un certain nombre de communautés apparentées, dont les caractères morphologiques distinctifs sont, de l’avis d’un systématiste compétent, suffisamment définis pour lui donner droit à un nom spécifique » (Regan, 1926: 75).
Le concept d’espèce biologique (BSC), tel que décrit par Mayr et Ashlock (1991), stipule qu ‘ « une espèce est un groupe de populations naturelles métissées qui est isolé reproductivement d’autres groupes de ce type ».,
Selon le concept d’espèce phylogénétique (PSC), tel que défini par Cracraft (1983), une espèce : « est le plus petit groupe d’organismes individuels diagnostiquables au sein duquel il existe un modèle parental d’ascendance et d’ascendance ». Ces concepts ne sont pas congruents, et un débat considérable existe sur les avantages et les inconvénients de tous les concepts d’espèces existants (pour plus de discussion, voir le module sur la macroévolution: essentials of systematics and taxonomy).,
En pratique, les systématistes regroupent généralement les spécimens selon des caractéristiques communes (génétiques, morphologiques, physiologiques). Lorsque deux groupes ou plus présentent des ensembles différents de caractères partagés, et que les caractères partagés pour chaque groupe permettent de distinguer tous les membres de ce groupe relativement facilement et de manière cohérente des membres d’un autre groupe, les groupes sont considérés comme des espèces différentes. Cette approche repose sur l’objectivité du concept d’espèce phylogénétique (c.-à-d.,, l’utilisation de caractères intrinsèques, partagés, pour définir ou diagnostiquer une espèce) et l’applique à la praticité du concept d’espèce morphologique, en termes de tri des spécimens en groupes (Kottelat, 1995, 1997).
Malgré leurs différences, tous les concepts d’espèces sont basés sur la compréhension qu’il existe des paramètres qui font d’une espèce une entité évolutive discrète et identifiable. Si les populations d’une espèce sont isolées, soit par des différences dans leur répartition (c.-à-d. l’isolement géographique), soit par des différences dans leur biologie de reproduction (c.-à-d.,, isolement reproductif), ils peuvent diverger, entraînant finalement une spéciation. Au cours de ce processus, nous nous attendons à voir des populations distinctes représentant des espèces naissantes – des espèces en cours de formation. Certains chercheurs peuvent les décrire comme des sous-espèces ou une autre sous-catégorie, selon le concept d’espèce utilisé par ces chercheurs. Cependant, il est très difficile de décider quand une population est suffisamment différente des autres populations pour mériter son classement en tant que sous-espèce., Pour ces raisons, les grades sous-spécifiques et infrasubspécifiques peuvent devenir des décisions extrêmement subjectives du degré de distinction entre les groupes d’organismes (Kottelat, 1997).
Une unité évolutive significative (UDE) est définie, en biologie de la conservation, comme un groupe d’organismes qui a subi une divergence génétique significative par rapport à d’autres groupes de la même espèce., Selon Ryder, 1986, l’identification des USE nécessite l’utilisation d’informations sur l’histoire naturelle, de données sur l’aire de répartition et la distribution et de résultats d’analyses morphométriques, cytogénétiques, allozymes et ADN nucléaire et mitochondrial. En pratique, de nombreuses UDE ne reposent que sur un sous-ensemble de ces sources de données. Néanmoins, il est nécessaire de comparer les données provenant de différentes sources (p. ex., analyses de distribution, morphométrie et ADN) pour établir le statut des USE., Si les UDE sont basées sur des populations sympatriques ou parapatriques, il est particulièrement important de démontrer une distance génétique significative entre ces populations.
Les UDE sont importantes pour la gestion de la conservation, car elles peuvent être utilisées pour identifier des composantes distinctes de l’héritage évolutif d’une espèce qui justifient une action de conservation. Néanmoins, en termes évolutifs et donc dans de nombreuses études systématiques, les espèces sont reconnues comme l’unité minimale identifiable de la biodiversité au-dessus du niveau d’un seul organisme (Kottelat, 1997)., Par conséquent, il existe généralement plus d’informations systématiques disponibles pour la diversité des espèces que pour les catégories sous-spécifiques et pour les UDE. Par conséquent, les estimations de la diversité des espèces sont utilisées plus fréquemment comme mesure standard de la biodiversité globale d’une région.
| Taxon | Taxon Nom Commun | Nombre d’espèces décrites* | N en pourcentage du nombre total d’espèces décrites* |
|---|---|---|---|
| Bactéries | true bactéries | 9021 | 0.,5 |
| Archaea | archaebacteria | 259 | 0.01 |
| Bryophyta | mosses | 15000 | 0.9 |
| Lycopodiophyta | clubmosses | 1275 | 0.07 |
| Filicophyta | ferns | 9500 | 0.5 |
| Coniferophyta | conifers | 601 | 0.03 |
| Magnoliophyta | flowering plants | 233885 | 13.4 |
| Fungi | fungi | 100800 | 5.,8 |
| « Porifera » | sponges | 10000 | 0.6 |
| Cnidaria | cnidarians | 9000 | 0.5 |
| Rotifera | rotifers | 1800 | 0.1 |
| Platyhelminthes | flatworms | 13780 | 0.8 |
| Mollusca | mollusks | 117495 | 6.7 |
| Annelida | annelid worms | 14360 | 0.8 |
| Nematoda | nematode worms | 20000 | 1.,1 |
| Arachnida | arachnids | 74445 | 4.3 |
| Crustacea | crustaceans | 38839 | 2.2 |
| Insecta | insects | 827875 | 47.4 |
| Echinodermata | echinoderms | 6000 | 0.3 |
| Chondrichthyes | cartilaginous fishes | 846 | 0.05 |
| Actinopterygii | ray-finned bony fishes | 23712 | 1.4 |
| Lissamphibia | living amphibians | 4975 | 0.,3 |
| Mammalia | mammals | 4496 | 0.3 |
| Chelonia | living turtles | 290 | 0.02 |
| Squamata | lizards and snakes | 6850 | 0.4 |
| Aves | birds | 9672 | 0.6 |
| Other | 193075 | 11.,0 |
Tableau \(\PageIndex{1}\) : Nombre estimé d’espèces décrites, D’après Lecointre et Guyader (2001) * Le nombre total d’espèces décrites est supposé être de 1 747 851. Ce chiffre, ainsi que le nombre d’espèces pour les taxons sont tirés de LeCointre et Guyader (2001).
Glossaire
Diversité des espèces Nombre d’espèces différentes dans une zone particulière (c.-à-d. richesse en espèces) pondéré par une certaine mesure de l’abondance, comme le nombre d’individus ou la biomasse., Richesse en espèces Nombre d’espèces différentes dans une zone donnée Régularité des espèces Abondance relative avec laquelle chaque espèce est représentée dans une zone. Diversité phylogénétique la parenté évolutive des espèces présentes dans une zone. Espèces morphologiques concept les espèces sont les plus petites populations naturelles séparées en permanence les unes des autres par une discontinuité distincte dans la série de biotypes (Du Rietz, 1930; Bisby et Coddington, 1995)., Concept d’espèce biologique une espèce est un groupe de populations naturelles métissées incapables de s’accoupler ou de se reproduire avec succès avec d’autres groupes de ce type, et qui occupe une niche spécifique dans la nature (Mayr, 1982; Bisby et Coddington, 1995). Concept d’espèce phylogénétique une espèce est le plus petit groupe d’organismes qui se distingue par diagnostic des autres groupes de ce type et au sein duquel il existe un modèle parental d’ascendance et d’ascendance (Cracraft, 1983; Bisby et Coddington, 1995)., Unité évolutive significative un groupe d’organismes qui a subi une divergence génétique significative par rapport à d’autres groupes de la même espèce. L’identification des USE est basée sur des informations d’histoire naturelle, des données de répartition et de distribution, et des résultats d’analyses morphométriques, cytogénétiques, allozymes et ADN nucléaire et mitochondrial. La concordance de ces données et l’indication d’une distance génétique significative entre les groupes sympatriques d’organismes sont essentielles à l’établissement d’une UDE. Écosystème une communauté plus l’environnement physique qu’elle occupe à un moment donné., Sympatrique occupant la même zone géographique. Parapatric occupant des plages contiguës mais ne se chevauchant pas.