Tämän alajakson Nimet ja taksonomian osa sisältää tyhjentävä luettelo kaikista nimistä proteiinia, alkaen yleisesti käytetty vanhentunut, jotta voidaan tunnistaa yksiselitteisesti proteiinia.
Tämä alaluokka sisältää myös tietoa toiminnan proteiinia, kuten tarkka kuvaus katalyyttinen mekanismi entsyymejä, tai tietoa yksittäinen proteiini ketjuja tai toiminnallinen verkkotunnukset sen sisällä, jos se on olennainen.,
UniProtKB/Swiss-Prot ’Proteiini nimet’ alajakso
alaluokka koostuu 2 luokat ja useita alaluokkia proteiinia nimet ja lyhenteet. Se alkaa aina Suositusnimellä (”RecName” tasatekstitiedostossa). Vaihtoehtoiset nimet on lueteltu kohdassa ”vaihtoehtoinen nimi(vaihtoehtoiset nimet)” (”AltName” tasatekstitiedostossa).
| Luokka-Kenttään | Alaluokka Kenttä | Mahtavuus | Kuvaus |
|---|---|---|---|
| Suositeltu nimi | 1 | Koko nimi suosittelema UniProt konsortio., | |
| Short name(s) | 0-n | Abbreviation of the full name or acronym. | |
| EC | 0-n | Enzyme Commission number. | |
| Alternative name(s) | 0-n | Synonym of the recommended name (full name). | |
| Short name(s) | 0-n | Abbreviation of the full name or an acronym. | |
| EC | 0-n | Enzyme Commission number., | |
| Alternative name(s) | Allergen | 0-1 | See Allergen nomenclature and list of entries. |
| Alternative name(s) | Biotech | 0-1 | Name used in a biotechnological context. |
| Alternative name(s) | CD_antigen | 0-n | See Human cell differentiation molecules nomenclature and list of entries., |
| Vaihtoehtoinen nimi(s) | INN | 0-n | Kansainvälisen nonproprietary nimi: yleisnimi lääke aine tai vaikuttavien ainesosa, joka on maailmanlaajuisesti tunnustettu julkista omaisuutta. |
Jos proteiini on tiedossa, voidaan halkaistut useita toiminnallisia osia, kuvaus alkaa nimi esiaste proteiinia, jonka jälkeen ’Pilkkoa …”pääluokka(t). Jokainen komponentti on kuvattu erillisessä osassa. ”Vaihtoehtoiset nimet” sallitaan kunkin yksittäisen komponentin osalta.,
Esimerkki: P01189 (’Halkaistut seuraavat 11 ketjut:’)
Jos proteiini on tiedossa sisältää useita toiminnallisia verkkotunnuksia, joista jokainen on kuvattu eri nimi, kuvaus alkaa nimi koko proteiini, jota seurasi ”mukaan Lukien” – osiossa(s). Kukin verkkotunnus on kuvattu erillisessä osassa. ”Vaihtoehtoiset nimet” ovat sallittuja kunkin yksittäisen verkkotunnuksen osalta.,
Esimerkki: P27708 (mukaan Lukien seuraavat 3 verkkotunnukset:’)
UniProtKB/vapina hu ’Proteiini nimet’ alajakso
muoto ’Proteiini nimet-osio UniProtKB/vapina hu seuraa tiiviisti muotoa käytetään UniProtKB/Swiss-Prot. Kuitenkin, kuten UniProtKB/vapina hu ei manuaalisesti selityksineen, kuvaus on tuotu suoraan taustalla nukleotidin merkintä ja sen tarkkuus perustuu toimittamien tietojen lähettäjän nukleotidin merkintä. Tämä on miksi UniProtKB/vapina hu merkinnät yleensä on Toimitettu nimi’ (’SubName’ tasainen tekstitiedosto) eikä ’Suositeltava nimi’., ”Toiminimi” voi olla useampi kuin yksi. ’Toimitti nimet’ voi myöhemmin olla parannettu automaattinen merkintä menettelyt (label sitten vaihtaa ’SubName” ja ”RecName’), mutta jos ei, se pysyy sellaisena kuin lähettäjä, kunnes merkintä on manuaalisesti selityksineen ja integroitu UniProtKB/Swiss-Prot.