Uracil N-glycosylase (UNG) er et en .ym, der anvendes i en kraftfuld metode til at eliminere overførselspolymerasekædereaktion (PCR) produkter i realtid PCR. Denne metode modificerer PCR-produkter, således at eventuelle restprodukter fra tidligere PCR-amplifikationer i en ny reaktion fordøjes og forhindres i at forstærke, men de sande DNA-skabeloner påvirkes ikke., PCR syntetiserer rigelige amplifikationsprodukter hver runde, men forurening af yderligere runder af PCR med spormængder af disse produkter, kaldet carry-over forurening, giver falske positive resultater. Overførsel forurening fra nogle tidligere PCR kan være et væsentligt problem, både på grund af den overflod af PCR produkter, og den ideelle struktur af det forurenende materiale til re-amplifikation., Men carry-over kontaminering kan være styret af de to følgende trin: (i) at indarbejde dUTP i alle PCR-produkter (ved at erstatte dUTP for dTTP, eller ved at indarbejde uracil under en syntese af primere; og (ii) behandling af alle efterfølgende fuldt formonteret starter reaktioner med uracil DNA glycosylase for (UDG), efterfulgt af termisk inaktivering af UDG. UDG spalter uracil-basen fra phosphodiester-rygraden i uracilholdigt DNA, men har ingen virkning på naturligt (dvs.thyminholdigt) DNA., De resulterende apyrimidiniske steder blokerer replikation af DNA-polymeraser og er meget labile over for syre/basehydrolyse. Fordi UDG ikke reagerer med dTTP, og er også inaktiveres ved opvarmning denaturerings-forud for den faktiske PCR, carry-over kontaminering af pcr ‘ er kan styres effektivt, hvis de forurenende stoffer indeholder uracils i stedet for thymines.
Uracil n-glykosylase blev også brugt i en undersøgelse til at påvise bevis for igangværende metabolisk aktivitet på lavt niveau og DNA-reparation i gamle bakterier., Langsigtede overlevelse af bakterier kan ske enten gennem endospore formation (hvor bakterien kommer ind i alt vækstdvale, med ingen metaboliske aktivitet overhovedet finder sted, og dermed ingen DNA-reparation), eller andet gennem reduktion af metaboliske aktivitet til en meget lav rente, netop er tilstrækkeligt til at udføre igangværende reparation af DNA og forhindrer nedbrydningen af andre ustabile molekyler (såsom ATP), i hvilken bakterie er i stand til at reparere skader på DNA, men også fortsat langsomt forbruge næringsstoffer. DNA-sekvenser fra bakterier i permafrost blev forstærket under anvendelse af PCR., En række kørsler forstærkede DNA-sekvenserne som de er (for at detektere alt levende bakterielt DNA i prøverne), mens den anden serie kiggede specifikt efter DNA, der havde gennemgået løbende reparation; for at gøre dette blev DNA ‘ et behandlet med UNG for at fjerne uracils. Dette forhindrede forstærkning af ikke-udbedrede DNA på to måder: for det første, det grundlæggende websteder, der genereres ved fjernelse af uracils forhindret DNA-polymerase bruges i PCR fra at gå videre forbi det sted, skade, mens disse grundlæggende sites også direkte har svækket DNA og gjort det mere sandsynligt, at fragmentere ved opvarmning., På denne måde kunne forskerne vise bevis for løbende DNA-reparation i Gram-positive bakterier med høj GC op til 600.000 år gamle.
Uracil n-glykosylase er også blevet anvendt i en metode til kloning af PCR-amplificerede DNA-fragmenter. Ved denne metode syntetiseres primerne anvendt i PCR med uracilrester i stedet for thymin. Når disse primere inkorporeres i PCR-amplificerede fragmenter, bliver primersekvensen modtagelig for fordøjelse med Uracil n Glykosylase og frembringer 3′ fremspringende ender, der kan udglødes til et passende forberedt vektor-DNA., De resulterende kimære molekyler kan omdannes til kompetente celler med høj effektivitet uden behov for in vitro ligering.