dette underafsnit i afsnittet navne og taksonomi indeholder en udtømmende liste over alle navne på proteinet, fra almindeligt anvendt til forældet, for at muliggøre entydig identifikation af et protein.
dette underafsnit indeholder også information om proteinets aktivitet, såsom en præcis beskrivelse af en .ymernes katalytiske mekanisme eller information om individuelle proteinkæder eller funktionelle domæner indeholdt i det, hvis relevant.,
UniProtKB/Swiss-Prot “Protein navne’ underafdeling
Det punkt består af 2 kategorier og flere underkategorier af protein, navne og forkortelser. Det begynder altid med’ anbefalet navn ‘(‘RecName’ i den flade tekstfil). Alternative navne er angivet under overskriften ‘ Alternative navn (er)’ (‘AltName’ i den flade tekstfil).
| Kategori Felt | Underkategori Felt | Brug | Beskrivelse |
|---|---|---|---|
| Anbefalet navn | 1 | Fulde navn, der anbefales af UniProt-konsortiet., | |
| Short name(s) | 0-n | Abbreviation of the full name or acronym. | |
| EC | 0-n | Enzyme Commission number. | |
| Alternative name(s) | 0-n | Synonym of the recommended name (full name). | |
| Short name(s) | 0-n | Abbreviation of the full name or an acronym. | |
| EC | 0-n | Enzyme Commission number., | |
| Alternative name(s) | Allergen | 0-1 | See Allergen nomenclature and list of entries. |
| Alternative name(s) | Biotech | 0-1 | Name used in a biotechnological context. |
| Alternative name(s) | CD_antigen | 0-n | See Human cell differentiation molecules nomenclature and list of entries., |
| Alternative navn(e) | INN | 0-n | Internationale ikke-beskyttet navn: en generisk betegnelse for en farmaceutisk stof eller aktive farmaceutiske ingrediens, som er en globalt anerkendt offentlig ejendom. |
Hvis et protein vides at blive spaltet i flere funktionelle komponenter, starter beskrivelsen med navnet på precursorproteinet, efterfulgt af ‘spaltet ind … afsnit(r). Hver komponent er beskrevet i et separat afsnit. ‘Alternative navne’ er tilladt for hver enkelt komponent.,
Eksempel: P01189 (‘Kløvet i følgende 11 kæder:’)
Hvis et protein, der er kendt for at indeholde flere funktionelle domæner, der hver beskrives ved et andet navn, beskrivelsen begynder med navnet på det hele protein, efterfulgt af “Herunder” sektion(s). Hvert domæne er beskrevet i et separat afsnit. ‘Alternative navne’ er tilladt for hvert enkelt domæne.,
Eksempel: P27708 (Herunder følgende 3 domæner:’)
UniProtKB/TrEMBL “Protein navne’ underafdeling
form af Det “Protein navne” i UniProtKB/TrEMBL følger nøje med det format, der bruges i UniProtKB/Swiss-Prot. Da UniProtKB/TrEMBL imidlertid ikke er manuelt kommenteret, importeres beskrivelsen direkte fra den underliggende nukleotidindgang, og dens nøjagtighed afhænger af oplysningerne fra indsenderen af nukleotidindgangen. Dette er grunden til, at UniProtKB / TrEMBL-poster normalt har ‘indsendt navn’ (‘undernavn’ i den flade tekstfil) i stedet for ‘anbefalet navn’., Der kan være mere end et ‘indsendt navn’. ‘Indsendte navne’ kan senere forbedres ved hjælp af automatiske annotationsprocedurer (etiketten ændres derefter fra ‘undernavn’ til ‘RecName’), men hvis ikke, forbliver den som angivet af indsenderen, indtil posten er manuelt kommenteret og integreret til UniProtKB/s .iss-Prot.