Tento pododdíl Jména a taxonomie sekce poskytuje vyčerpávající seznam všech jmen z bílkovin, z běžně používá zastaralé, umožňující jednoznačnou identifikaci bílkoviny.
Tento pododdíl obsahuje také informace o činnosti bílkoviny, jako je přesný popis katalytickém mechanismu enzymů, nebo informace o jednotlivých proteinových řetězců nebo funkčních domén obsažené v něm, pokud je to relevantní.,
UniProtKB / Swiss-prot ‚proteinové názvy‘ pododdíl
pododdíl se skládá ze 2 kategorií a několika podkategorií proteinových názvů a zkratek. Vždy začíná „doporučeným názvem“ („RecName“ v plochém textovém souboru). Alternativní názvy jsou uvedeny pod nadpisem „Alternativní název(názvy)“ („AltName“ v plochém textovém souboru).
| Kategorie Pole | Podkategorie Pole | Mohutnost | Popis |
|---|---|---|---|
| Doporučený jméno | 1 | Plné jméno doporučuje UniProt consortium., | |
| Short name(s) | 0-n | Abbreviation of the full name or acronym. | |
| EC | 0-n | Enzyme Commission number. | |
| Alternative name(s) | 0-n | Synonym of the recommended name (full name). | |
| Short name(s) | 0-n | Abbreviation of the full name or an acronym. | |
| EC | 0-n | Enzyme Commission number., | |
| Alternative name(s) | Allergen | 0-1 | See Allergen nomenclature and list of entries. |
| Alternative name(s) | Biotech | 0-1 | Name used in a biotechnological context. |
| Alternative name(s) | CD_antigen | 0-n | See Human cell differentiation molecules nomenclature and list of entries., |
| Alternativní název(y) | HOTEL | 0-n | Mezinárodní nechráněný název: generický název pro farmaceutické látky nebo aktivní farmaceutická složka, která je celosvětově uznávanou veřejného majetku. |
v Případě, že protein je známo, že se štěpí do několika funkčních částí, popis začíná se jménem prekurzor bílkovin, následuje ‚Štěpí do …“sekce(sekce). Každá součást je popsána v samostatné části. „Alternativní názvy“jsou povoleny pro každou jednotlivou součást.,
Příklad: P01189 (Dále Štěpí do následujících 11 řetězců:‘)
v Případě, že protein je známo, že obsahují více funkčních domén, z nichž každá popisuje jiný název, popis začíná se jménem celého proteinu, následuje „Včetně“ sekce(y). Každá doména je popsána v samostatné části. „Alternativní názvy“ jsou povoleny pro každou jednotlivou doménu.,
Příklad: P27708 (‚Včetně těchto 3 domén:‘)
UniProtKB/TrEMBL ‚Protein jména‘ pododdíl
formát ‚Protein názvy oddíl v UniProtKB/TrEMBL úzce navazuje na formát používaný v UniProtKB/Swiss-Prot. Jelikož však UniProtKB / TrEMBL není ručně anotován, je popis importován přímo z podkladového vstupu nukleotidu a jeho přesnost se opírá o informace poskytnuté zadavatelem vstupu nukleotidu. To je důvod, proč položky UniProtKB/TrEMBL mají obvykle „předložené jméno“ („název“ v plochém textovém souboru) namísto „doporučeného názvu“., Může existovat více než jedno „předložené jméno“. ‚Předloženy názvy později může být zlepšena pomocí automatické anotace postupy (označení se pak změna z ‚SubName“ na „RecName‘), ale pokud ne, zůstává podle zadavatele, dokud položka je ručně anotovány a integrované UniProtKB/Swiss-Prot.